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Genome sequence analysis of the oligosaccharide-producing strain Leuconostoc lactis SBC001
올리고당을 생성하는 Leuconostoc lactis SBC001의 유전체 서열 분석
- 박지선;
- 이설희;
- 박영서
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본 연구에서는 부추에서 분리한 Leuconostoc lactis SBC001 의 유전체 염기서열 해독을 PacBio SMRT platform을 사용하여 수행하였다. 그 결과, 유전체의 길이는 1,835,155 bp, G + C 함량은 43.1%로 구성되었다. 전체 단백질 암호화 유전자 1,689 개, 12개의 rRNA 유전자, 67개의 tRNA 유전자, 3개의 ncRNA, 45개의 pseudo 유전자가 확인되었다. ANI 분석에 따른 L. lactis SBC001과 유사도가 가장 높은 균주는 L. lactis UBA5566 (98.49%)로 확인되었고, 여러 탄수화물 분해 및 합성 효소를 보유하고 있으며, 특히 올리고당 합성에 관여하는 glycosyltransferase (EC 2.4.1.7), β-galactosidase (EC 3.2.1.23), maltose phosphorylase (EC 2.4.1.8)와 dextransucrase (EC 2.4.1.5) 효소를 지니고 있었다.
키워드
Leuconostoc lactis; dextransucrase; draft genome sequence; lactic acid bacteria; oligosaccharides
- 제목
- Genome sequence analysis of the oligosaccharide-producing strain Leuconostoc lactis SBC001
- 제목 (타언어)
- 올리고당을 생성하는 Leuconostoc lactis SBC001의 유전체 서열 분석
- 저자
- 박지선; 이설희; 박영서
- 발행일
- 2021-12
- 저널명
- 미생물학회지
- 권
- 57
- 호
- 4
- 페이지
- 286 ~ 288
- 언어
- ENG
- 출판사
- 한국미생물학회
- 발행국가
- 대한민국
- 분량
- 3 페이지
- ISSN
- P 0440-2413